针对敌人的阴谋，彭德怀提出三个基本任务，并对其相互关系作了详细说明。
一、关于伪军伪组织的工作问题。彭德怀分析说，由于敌人的残酷压迫，民族矛盾的激化，全国抗战、特别是敌后抗战的坚持，伪军伪组织发生不安和动摇。但由于敌强我弱的形势，使得一般汉奸尚不愿立刻跑到我们方面来，这就产生了伪军伪组织中的两面派--动摇于敌我之间，既照顾敌人，又照顾我们。彭德怀指出，过去对这种人一律打击是不对的。正确做法应当是，推动其进步，使他们从两面照顾到对敌应付，而对我真诚。要替这些人寻找办法应付敌人，替他们保守秘密，尊重其人格。而对于伪军伪组织这一傀儡组织本身，则应反对之、打击之、孤立之，对死心塌地的汉奸，还要坚决镇压之。彭德怀说，要在中国人不打中国人、中国人爱护中国人的口号下，去争取两面派，“七擒七纵”的办法是有极深刻意义的。
二、对于敌占区和接敌区的群众工作，彭德怀提出要广泛运用革命的两面派的政策，打入一切有群众的组织，利用一切合法手段，开展救国工作；团结一切中国人，保护一切中国人的利益，人民少受一分损失，即民族多保存一分元气；和群众一起共同商讨应付鬼子、欺骗鬼子的方法，从长期打算，积蓄力量；反对痛快一时，使群众遭受不应有的打击。敌寇特别注意收买和胁迫知识分子参加汉奸特务组织。彭德怀强调，知识分子联系的社会阶级面最广，是开展敌占区、接敌区工作的桥梁。他坚信中国知识分子大多数有强烈的民族意识，执行正确的政策，进行艰苦的工作，必能争取其为民族服务。
针对敌人对华北实行自首政策以瓦解我抗日组织的阴谋(如强迫群众写反共口号，填反共自愿书，买回心票，胁迫党员和抗日干部家属逼干部回家，策动秘密自首等)，彭德怀提出要加强气节教育，同时对被胁迫叛变者，仍争取其回头抗日或保持中立。改变过去对自首者一律打击的做法。
三、关于坚持根据地的工作问题，彭德怀着重指出：由于敌人的封锁、切割，运动战的机会已大大减少，甚至在平原地区成为不可能，普遍的游击战将成为最基本的战争形式。要求大家把武装建设的重心放在地方武装的建设上，建设数百支脱离生产的、强有力的游击队和百万不脱离生产的有战斗力的民兵。彭德怀还设想，根据地边沿区的游击队和正规军，可以有计划地到敌占区去开展游击活动。利用乡村的散漫性，在新伪化的地区，组织起秘密的抗日武装。
11月3日，当会议继续进行之际，从黎城出动的2000余日军直扑根据地中心，作战参谋不断地报告敌情：敌人距开会地点40里，35里……傍晚，日军进至30里处，左权、刘伯承已进入作战指挥，会议暂告结束。彭德怀和开会的人从容离开下南会村，转入反“扫荡”作战。
11月10日，日军坂垣师团一个精锐旅在“扫荡”中突袭八路军总部特务团严密防守的总部黄崖洞兵工厂，彭德怀和左权直接指挥特务团坚守。在日军重炮、山炮、迫击炮的猛轰下，特务团凭险抗击，鏖战八昼夜，歼敌1000余人(其中击毙850人)。特务团伤亡160余人。日军攻入工厂区时，兵工厂工人已将机器掩埋转移。其后，总部兵工厂撤离黄崖洞。
黄崖洞保卫战中，总部特务团以6∶1的歼敌战绩，创敌我伤亡对比的最佳记录。黄崖洞战斗成为八路军历史上一次光辉战例。