红军改编时，由于蒋介石拒不承认，取消了红军的政治委员制，各师只设政训主任。出师不久，朱、彭、任(弼时)深感部队改编后，政治工作人员职权降低，军队建设受到损失，于1937年10月19日共同建议中共中央书记处，按红军传统建立八路军的党代表制，党代表职权与政委同。这一建议立即得到中央的采纳。3天之后，洛甫、毛泽东亲自复电，同意朱、彭、任的建议。此后，八路军恢复了红军时期实行的政治委员制度。
周昆的“牢骚”引起了朱德、彭德怀的高度重视，接着又发生了周昆在携3万元巨款回115师师部途中失踪，115师344旅687团团长张绍东、参谋长兰国卿逃到政府军中去当官的事件。彭德怀为此亲赴高平整顿。
一连串的事件，使彭德怀在王明和毛泽东的争论中，更倾向于毛泽东。在向344旅传达中央书记处根据王明在12月政治局会议上的报告所拟的提纲时，强调了从云阳改编时就强调的三条：保障共产党对八路军的绝对领导；保障工农成分在军队中的绝对优势；保障高度政治工作的传统。
在这个时期中，115师发生了3个士兵杀死友军(晋军)一负伤连长，劫去晋票100元的事件。不久，凶手在陕西之延长被捕获，朱、彭亲电毛泽东、滕代远，请将凶手送115师公审枪决，以此在部队中反对军阀土匪主义。
八路军总部朱、彭的以身作则，八路军政治工作的坚强有力，纪律的严格执行，使八路军在与国民党和社会各阶层广泛实行抗日合作的复杂环境中，保持了红军的优良传统，在全国的政治舞台上树立起一个与旧军队完全不同的形象，赢得了崇高的声誉。八路军不仅在军事上，而且在政治上胜利地实现了战略转变和战略展开，为随之而来的敌后长期艰苦斗争做好了准备。