1998年6月至2007年5月，石泉县县级政协领导机构为政协石泉县委员会，政协石泉县委员会历经第九、第十两届委员会。1998年6月至2003年2月，由政协石泉县第九届委员会主持工作。其间，共召开4次全委会。2003年2月，在政协石泉县第十届一次会议上，选举产生了政协石泉县第十届委员会领导机构，韩永进当选为县政协主席。
这一时期，政协石泉县委员会受中共石泉县委领导，接受政协安康市委员会（政协陕西省委员会安康地区工作委员会）的工作指导。机关驻地县城人民路（县政府大院内）。
1998年6月至2003年2月，为政协石泉县第九届委员会第一次会议选举产生的政协石泉县第九届委员会届期。1999年2月、2000年2月、2001年2月、2002年2月，县政协先后召开了九届二次、三次、四次、五次全委会议。其间，县政协共召开22次常委会议，至2003年2月，县政协有主席1人，副主席2人，秘书长1人，常务委员14人。2002年1月，增补常务委员1人。
主 席 于彩云（女，1998.6—2003.2）
副主席 李玉平（1998.6—2003.2）
许启昌（无党派，1998.6—2003.2）
秘书长 黄太芝（1998.6—2003.2）
常务委员 （按姓氏笔画排列）
王桂红（女，1998.6—2003.2）
刘传林（1998.6—2003.2）
刘合朝（1998.6—2003.2）
刘声凤（女，1998.6—2003.2）
刘康富（1998.6—2003.2）
李春模（1998.6—2003.2）
林桂兰（女，1998.6—2003.2）
张厚林（1998.6—2003.2）
陈国庆（1998.6—2003.2）
洪 军（1998.6—2003.2）
海文德（回族，1998.6—2003.2）
彭荣贵（1998.6—2003.2）
董才位（1998.6—2003.2）
戴腾亮（1998.6—2003.2）
张其洪（2002.1—2003.2）
2003年2月23日至26日，政协石泉县第十届委员会第一次会议在石泉宾馆召开。出席会议的委员104人，分别来自全县14个界别和单位。其中中共方面14人，县总工会3人，共青团3人，县妇联3人，县工商联9人，经济科技界19人，农民界7人，医药卫生界7人，教育界10人，文化艺术界1人，体育界1人，新闻界1人，少数民族2人，特邀人士24人。委员中有中共党员42人，女委员21人，具有大专以上文化47人，具有中级以上专业技术人员28人。会议听取并审议通过了于彩云代表政协石泉县第九届委员会所作的常务委员会工作报告，审议通过了政协石泉县第九届委员会提案法制委员会关于五年提案工作情况的报告。与会的政协委员列席了石泉县第十五届人民代表大会第一次会议，协商讨论了县政府工作报告和县人民法院、县人民检察院以及计划、财政5个工作报告；会议经过充分酝酿协商，选举产生了政协石泉县第十届委员会主席1人，副主席2人，秘书长1人，常务委员14人；审议通过了大会各项决议。
新当选的政协石泉县第十届委员会主席、副主席中，有中共党员2人，无党派人士1人；平均年龄45岁，大专以上文化3人。2003年2月至2007年5月期间，县政协分别于2004年2月、2005年1月、2006年4月先后召开了十届二次、三次和四次全委会议，共召开24次常委会议。至2007年5月，县政协有主席1人，副主席2人，秘书长1人，常务委员14人。
主 席 韩永进（中共，2003.2—2007.5）
副主席 何小丁（中共，2003.2—2007.5）
张厚林（无党派，2003.2—2007.5）
秘书长 尹平安（2003.2—2007.5）
常务委员 （按姓氏笔画排列）
弓冬梅（女，2003.2—2007.5）
王宝珍（女，2003.2—2007.5）
王桂红（女，2003.2—2007.5）
刘合朝（2003.2—2007.5）
刘昌兰（女，2003.2—2007.5）
李新华（女，2003.2—2007.5）
陈友宽（2003.2—2007.5）
沈少武（2003.2—2007.5）
赵以刚（2003.2—2007.5）
洪 军（2003.2—2007.5）
海文德（回族，2003.2—2007.5）
曹修群（女，2003.2—2007.5）
董才位（2003.2—2007.5）
鲍东黎（2003.2—2007.5）
吴礼银（2006.9—2007.5）